La réserve présente une mosaïque de milieux très humides sur tourbe et de milieux surélevés et plus secs sur grève calcaire :
- les zones tourbeuses se caractérisent par une végétation typique de marais : roselières, prairies humides, saulaies-aulnaies, anciennes fosses de tourbage…
- les zones plus sèches sont appelées sécherons et abritent une végétation de pelouse calcaire ou de prairie plutôt sèche parsemée de boisements de frênes, de chênes, de saules et de fruticées ou milieux buissonnants.